La Subsecretaría de Marina fue creada por Ley N° 5.077 de 1932, como una entidad dependiente del Ministerio de Defensa Nacional. Con anterioridad, todos los asuntos concernientes a la marina, la guerra naval y sus incidencias, estuvieron radicados en el Ministerio de Guerra y Marina (1822 y 1887), y en el Ministerio de Marina (1887-1932). No obstante, durante los meses de enero a junio de 1927, cuando por primera vez se constituyó un Ministerio de Defensa Nacional, Marina ya había detentado la calidad de Subsecretaría. Mantuvo igual rango y dependencia hasta la promulgación de la Ley N° 20.424 del año 2010, que entre otras materias, dispuso la fusión de la Dirección Administrativa del Ministerio de Defensa Nacional y de las subsecretarías de Guerra, Marina y de Aviación, en una Subsecretaría para las Fuerzas Armadas, sucesora para todos los efectos legales, reglamentarios y contractuales, de la anterior institucionalidad administrativa.
Esta sección del Fondo Ministerio de Defensa se encuentra organizado en las siguientes series documentales, que abarcan el periodo de la dictadura civil militar:
- Decretos Supremos Exentos (1973-1978 y 1980-1988),
- Decretos Supremos con Toma de Razón (1973-1990),
- Resoluciones (1983), Resoluciones Exentas (1973-1989),
- Resoluciones con Toma de Razón (1973-1990) y
- Órdenes (1973).
En su totalidad, este fondo abarca temáticas relativas a la contratación, nombramiento, ascenso, licencias, traslados y jubilaciones de funcionarios administrativos y navales; estados materiales y de tropa de la fuerza naval; creación de unidades e institutos navales; formación profesional de oficiales y suboficiales; construcción de naves en el extranjero y en el país; planificación y ejecución de obras de defensa naval; conservación y administración de faros; exploraciones hidrográficas; vigilancia y resguardo de la soberanía marítima; rescate de expediciones navales extranjeras, entre otras materias.
